课题组电脑上常见十几个软件,各有各的格式和操作。常用的那几步我们放进同一个网页:打开浏览器就能用,不用安装,也不用学命令行。
12 种常用图:GWAS、单倍型、群体结构、表型统计、qPCR、进化树、序列比对、结构域。多张图一键拼成 a/b/c 组图,导出 TIFF。
打开作图 →每天自动汇总 PubMed、bioRxiv、主要植物学期刊和订阅公众号的新文章,筛出作物遗传育种方向,配中文摘要。
看今天的 →上传 PDF 或填 DOI、公众号链接,拿到结构化的中文解读:方法、群体、阈值、主要发现、亮点和可以质疑的地方。
解读一篇 →按分析参数写 Methods、按图写图注、结果写成 Results 初稿,以及润色、中译英、审稿式挑刺。只辅助,不代写。
开始写 →| GraphPad Prism 画柱状图、箱线图、做显著性检验 | → | 表型统计图t 检验 / ANOVA + Tukey 字母标注 |
| CFX Manager / Excel 算 2−ΔΔCt | → | qPCR 相对表达直接读 Ct 表,算完出图带统计 |
| MEGA 建树 + iTOL 美化 | → | 进化树读 Newick,或直接从序列建 NJ 树 |
| Jalview / ESPript 看比对、出比对图 | → | 序列比对图 |
| InterPro / IBS / DOG 画结构域 | → | 蛋白结构域图 |
| Tassel、Haploview 出图,R 里调曼哈顿图、QQ 图 | → | 曼哈顿 · QQ · LD 热图 |
| Structure / ADMIXTURE 结果画条形图,PCA 再画一遍 | → | 祖先成分 · PCA |
| TBtools 画基因结构、单倍型 | → | 单倍型组图 · 单倍型箱线图 |
| Illustrator 里把几张图对齐、加 a/b/c | → | 组图拼版作图台右侧「加入组图」 |
| 刷公众号、期刊官网、bioRxiv 找新文章 | → | 前沿速递 |
| SnapGene / EditSeq 看质粒、设计引物;PyMOL 看结构;Image Lab / ZEN 处理凝胶和显微图 | → | 暂不替代:这类软件和仪器、本地文件绑定得紧,继续用原软件更合适 |
课题组有固定的分析需求、现有软件做不了或太慢,我们可以按你的数据开发专用算法或自动化流程,做成网页工具或装到你们的服务器上。
作物 GWAS 论文里,第一张图通常是关联分析,倒数第二张常是候选基因的单倍型。我们把这两组图从计算到排版做完,所有元素在 SVG 里都能调。
基因结构、变异位点、单倍型表和各单倍型的表型差异,一组图讲清「哪个等位基因有用」。
已经有结果表,用免费工具出图;只有原始数据,或者想要专家把关,交给我们算。
上传 GEMMA、PLINK、GAPIT、ADMIXTURE 的结果表,或表型、Ct 值、序列,浏览器里直接出图。
不写代码跑完 GWAS 和单倍型分析。没有自己的数据,可以直接用 3K 水稻公共数据选材料。
群体结构没校正、阈值选错、候选区间划错,这类错误看图看不出来,却会进到论文里。所以每一步都有固定做法。
工具、版本和参数用模板固定,同样的数据跑两次结果一样。
样本量、缺失率、λGC,以及已知基因(如 GS3、GW5)能否复现,不过关就停。
用已发表的作物 GWAS 论文做对照,流程要能复现原文结论才上线。
分析包交付前,由育种方向的专家逐图复核。
数据整理、跑流程、出图、写 Methods 草稿,由我们的分析流水线完成,交付快、价格低。
生物学上是否合理、候选基因怎么挑,由人判断。我们不做论文代写,也不承诺「创新点」。
有私有群体数据的课题组,最担心的是数据泄露。分析流程和作图可以整套装到你们自己的服务器上。
装在课题组服务器或单位内网,数据不经过我们。
测序公司还没有植物群体遗传分析能力的,我们可以做你们的售后分析,或者联合交付。
现在先做水稻(参考基因组 Nipponbare IRGSP-1.0)。免费作图工具不限物种,只要是标准的结果表就能画。玉米、小麦、大豆排在水稻之后。
不会。作图工具在你的浏览器里读文件、计算和出图,数据不发到任何服务器。可以断网后再试一次验证。
SVG 里文字是文字、元素按图层分组,可以在 Illustrator、Inkscape 或 PPT 里继续改字体、颜色和排版;位图可导出 300 dpi 的 TIFF。投稿前请按期刊要求核对尺寸和字号。
按项目报价,取决于物种、样本量、数据类型和要几组图。目前接受试单,请先发邮件说明项目情况。
不代写。写作助手只根据你提供的分析参数和结果,起草 Methods、图注、Results 段落,或者润色、翻译、挑问题;不会编数据和参考文献,缺的信息会标成 [待补充]。投稿时请按期刊要求声明使用了 AI 辅助。
用的是阿里云通义千问(国内备案的大模型)。论文解读和写作助手的内容只用于当次生成,我们不保存原文。AI 生成的内容可能有错,关键数字请回原文核对。免费使用有每日次数限制。
试单、内测、定制开发、私有化部署、测序公司合作,都发到这个邮箱。
wujinseed@163.com